①体力槽：游戏角色拥有两条体力槽，一旦第二条体力槽清空则此角色被击败。体力低于一定的情况下角色才有可能使用觉醒。
②查克拉：游戏中的很多技能需要查克拉，比如忍术、奥义、查克拉冲刺、查克拉手里剑等，所以在游戏中玩家需要时时注意自己的查克拉余量。角色的查克拉可以随时间慢慢恢复，如果查克拉太少就需要通过“制造查克拉”或者进行快速恢复。中间的标志为奥义使用临界点。
③风暴槽：使用队友援助能够积攒风暴值，一旦风暴值达到一半时可以使用特殊援助技能，此时场上人物会发出黄色的光芒；风暴值到最大值则可以发动联手觉醒或联手奥义，此时角色头像会有燃烧的火焰效果。
④替身槽：替身槽满时一名角色可最多使用4次替身术，之后替身槽会慢慢恢复。
⑤援助队友：使用对应的按键呼叫援助队友，呼叫一名队友后需要一定时间冷却后才可以再次使用这名队友。
⑥剩余时间：如双方均的体力值均未清零，剩余时间归零时生命值较多的一方获胜。
⑦行动提示：达到一定条件时系统会提示玩家使用相应的技能，如联手奥义或觉醒等。
⑧道具槽：按下十字键使用对应道具。十字键上键为破防攻击。
攻击：○/B 连续使用攻击并配合左摇杆可以打出不同的连击。
替身术：在对手攻击命中前后使用L2/LT，这样可以免受伤害或脱离被对手的连续攻击，替身术不消耗查克拉，但会消耗替身槽。
摔掷：R2/RT+○/B 相当于投技，在对手靠近自己时使用摔掷能够对对方造成一定程度的伤害。
击溃防御：当对手防御时，对其进行连续攻击能够造成对手破防。或者使用十字键的上键进行击溃防御攻击，如果此攻击命中也能够造成对手破防。但需要注意，此攻击在每局游戏中只能使用有限次数。
回击技：R2/RT+□/X 在对手攻击前的一瞬间将其弹回并击倒（类似格斗游戏中的“爆霸”），此技能需要消耗查克拉上限，随后查克拉上限会慢慢恢复。
类似于“爆霸”的回击技
手里剑：□/X 有些角色的可以连续使出手里剑形成连击。
二段跳：使用×/A跳跃到空中后再摁×/A。
忍者移动：忍者移动是一种比较迅速的移动方式，用于闪避对方的技能。在使用×/A跳跃到空中再推动左摇杆的同时摁下×/A，或者在此时摁住×/A可以连续记性快速移动。另外摁住R2/RT再推动左摇杆也能够进行忍者移动。
忍者冲刺：双击×/A 忍者可以快速靠近对手，但不会消耗查克拉。
忍者冲刺
空中翻身：可以使角色快速起身，需要玩家在被击飞时，长摁住×/A。
制造查克拉：摁住△/Y 在不受到攻击的情况下，游戏角色可以通过制造查克拉持续恢复自己的查克拉。另外，角色受到攻击时，会有一些白球掉落在场景中，这就是查克拉。这时摁下△/Y可以迅速收集身边的查克拉。
凝聚查克拉：△/Y 凝聚查克拉之后再按下对应的按键，角色可以使用一些消耗超查克拉的技能。
查克拉手里剑：△/Y凝聚查克拉，然后迅速使用手里剑（摁□/X）。此时角色可以使出查克拉强化版的手里剑。
查克拉冲刺：△/Y，然后×/A。与忍者冲刺类似查克拉冲刺也是一种迅速靠近对手的移动方式，但此移动会消耗一定查克拉。
查克拉冲刺
蓄积查克拉冲刺：△/Y，然后摁住×/A。角色先蓄积查克拉，随后进行查克拉冲刺。通过此种方式能够得到比普通查克拉冲刺更远的冲刺距离，而且靠近对手的速度更快。
查克拉后退冲刺：△/Y，然后推动左摇杆向角色背后的同时摁×/A。这是一种迅速脱离战斗的移动方式。
忍术：△/Y凝聚查克拉，然后摁○/B。不同的角色能够使用不同的忍术，一些角色在空中进行此操作能够使用不同的忍术，或者可以强化忍术的效果。
奥义：在拥有足够查克拉的情况下摁下△/Y，△/Y，○/B。
联手奥义：在风暴值达到最大值时摁下△/Y，△/Y，△/Y，○/B。在选择了特定角色组合的情况下，使用联手奥义会有不一样的演出效果。特定组合为原著剧情中有着特殊关系的角色，如“新三忍”、“三忍”、初代至三代火影、“第七班”、鸣人一家三口、鸣人夫妇等。
雷影兄弟的联手奥义
觉醒：在体力低于一定量的情况下，摁住△/Y。角色发动觉醒之后各方面能力大幅上升，有些角色的外貌发生改变并且技能发生改变。觉醒状态只会持续一段时间，如果战斗未结束角色恢复到普通状态，则角色会呈现虚弱状态，各项能力会下降一段时间。
联手觉醒：在风暴值达到最大值时，且在体力低于一定量的情况下，摁住△/Y。发动联手奥义后己方所有角色都会同时觉醒。
联手觉醒
本作对于系列以来的支援队友系统进行了较大的革新，为了让大家更快速地适应这些改变，特此对新的支援队友系统进行说明。
在本作中的组队战中，玩家可以选择2-3名角色作为参展角色。首先选择的一名角色作为战斗开始时的操控角色（即“队长”），而另外的1至2名角色则作为支援角色，在战斗过程中支援角色冷却完毕就可以呼叫对应的队友进场支援。此次的《火影忍者疾风传：究极忍者风暴4》中不再区分战斗角色和支援角色，在战斗中玩家能够将所控制的角色切换成为原本的支援角色。并且玩家也可以先呼叫支援角色上场，然后随即切换使用该角色。
而除了在战斗呼叫支援以及切换成为可操作角色外，支援队友在战斗中还能够起到一些其他的特殊效果。在本作中，每个角色都对应了一种支援属性，在一定条件下支援角色会自动登场，给予在场队长一定的帮助。
发动此类效果的首要条件为在风暴值积攒到一半以上，此时角色身上会发出黄色的光芒。另一必要条件为对应的支援角色冷却完毕。
支援射击，风暴值积攒到一半以上角色身上会发出黄色的光芒
以下是游戏角色的各种援助属性与说明：
打回原地：拥有这一属性的支援角色可以在己方队长击飞对手时自动登场，将对手打回来。
支援射击：在队长进行查克拉手里剑攻击时自动登场，使用查克拉手进行配合。
集气防御：在队长制造查克拉时自动登场，协助进行防御。
溃防防御：在队长被击溃防御时自动登场，协助其进行防御。
奥义替身：在队长被大会原地时可摁下L1/LB或R1/RB登场，并代替队长承受攻击。在被击出场外的瞬间召唤拥有替身属性的队友可让其利用替身进行救援。在被奥义击中前一瞬间召唤队友可让其代为承受奥义伤害。
集气协助：在队长制造查克拉是自动登场，帮助队长快速回复查克拉。
阻止冲击：在对手进行忍者冲刺和查克拉冲刺时自动登场，能够阻止冲刺过来的对手。
奥义替身前一瞬间
